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Prof. Francisco Prosdocimi

DISCIPLINA BIOQUÍMICA

Farmácia/UFRJ, 2011, segundo semestre.

A disciplina é dividia em 4 partes, a saber:

1) Introdução ao estudo das proteínas e enzimas
2) Introdução ao estudo do DNA e da biologia molecular
3) Introdução ao estudo dos carboidratos
4) Introdução ao estudo dos lipídeos

Clique aqui para fazer o download do Plano de Ensino tentativo.


== PARTE 1 -- Proteínas e enzimas ==

AULA 1

Aula teórica: A lógica molecular da vida.
Onde estudar: Lehninger, capítulo 1

Conceitos importantes:

  • Anabolismo X Catabolismo
  • Quatro principais biomoléculas: proteínas, ácido nucléicos, carboidratos, lipídeos
  • Embora a vida seja imensamente diversa, quando se olha para os organismos em nível molecular percebemos uma enorme similaridade de mecanismos
  • A similaridade molecular entre organismos é evidência da evolução
FTP: LógicaMolecularDaVida.ppt
Estudo sugerido (opcional): Escreva uma resenha de uma página sobre o documentário Cosmos (55min), filme 11, do físico americano Carl Sagan. Descreva qual a parte você achou mais interessante do filme e por quê.

Carl Sagan, físico americano criador da série Cosmos
Carl Sagan foi um dos maiores divulgadores de ciência de seu tempo. Tendo escrito dezenas de livro e até ficções científicas, ajudou incrivelmente na educação científica da população. Saiba mais sobre a série de documentário Cosmos.



AULA 2


Aula teórica:Aminoácidos, peptídeos e proteínas.
Onde estudar: Lehninger, capítulo 3

Conceitos importantes:

  • As proteínas são unidades poliméricas feitas por aminoácidos
  • Existem 20 aminoácidos diferentes cujas propriedades químicas de suas cadeias laterais são responsáveis por esta diferença e modificam as interações fisico-químicas das proteínas
  • Os aminoácidos podem ser representados por sequências de uma ou três letras
  • A estrutura primária de uma proteína é dada pela sequência de aminoácidos que a compõem
  • A função bioquímica das proteínas pode ser estudada com detalhe
  • O estudo das proteínas passa primeiro pela purificação delas através de técnicas de cromatografia
FTP: Aminoacidos.ppt


AULA 3

Aula teórica: Estrutura tridimensional de proteínas
Onde estudar: Lehninger, capítulo 4

Conceitos importantes:

  • A função das proteínas é altamente dependente da sua estruturação tridimensional no espaço
  • A ligação peptídica é planar; omega = 180°
  • A estrutura das proteínas se dá principalmente por variações nos ângulos phi e psi
  • Nem todos os ângulos phi e psi são permitidos, diagrama de ramachandran identifica as posições possíveis
  • A alfa-hélice é a estrutura secundária mais comum entre as proteínas
  • Na alfa-hélice temos 3,6 resíduos de aminoácidos por volta, onde a estrutura local é estabilizada por pontes de hidrogênio
  • As folhas beta são conformações secundárias bastante comuns nas proteínas
  • As folhas beta podem ser paralelas ou anti-paralelas
  • As voltas-beta são as pontes que ligam as folhas beta
  • As proteínas podem ser fibrosas ou globulares
  • A estrutura terciária das proteínas é formada pela interação global entre os elementos de estrutura secundária no espaço tridimensional (largura, altura, comprimento)
  • As proteínas precisam se enovelar em uma forma nativa, de baixa de energia, para funcionarem bem
  • A forma mais comum e funcional da proteína enovelada é chamada de forma nativa
  • Algumas proteínas não são capazes de se enovelar sozinhas e para isso existem complexos multiméricos de proteínas chamadas chaperonas
FTP: Estrutura3D.ppt
  • Sítio do PDB, o banco de dados de estruturas de proteínas
  • Sítio do Rasmol, programa visualizador de estruturas de proteínas

AULA 4

Aula teórica: Função protéica
Onde estudar: Lehninger, capítulo 5

Conceitos importantes:

  • As funções das protéinas são dependentes de sua conformação tridimensional

FTP:
FuncaoProteica.ppt


AULA 5

Aula teórica: Enzimologia

FTP:
Enzimologia.ppt
Onde estudar: Lehninger, capítulo 6

Conceitos importantes:


PARTE 2 -- O DNA e a biologia molecular
AULA 6

Aula teórica: O empacotamento do DNA no núcleo.
Leitura sugerida: Texto sobre a Epigenômica.



AULA 7


Aula teórica: O processo de replicação do DNA.



AULA 8


Aula teórica: O processo de transcrição em procariotos e eucariotos. Edição (splicing) e poliadenilação do RNA. O controle da expressão gênica. RNAi.
FTP: Transcrição.pdf
Leitura sugerida: Sítio web sobre Síntese e Processamento do RNA.



AULA 9


Aula teórica: O processo de tradução em procariotos e eucariotos. O código genético.
FTP: Tradução.pdf


AULA 10

Aula teórica: O DNA recombinante, histórico. Clonagem gênica.
FTP: DNARecombinante_ClonagemGenica.pdf
Para discutir em sala de aula: o julgamento dos transgênicos.
Estudo dirigido: Eletroforese_clonagem_enzimasDeRestricao.doc



Prof. Francisco Prosdocimi